中國高等航海教育發軔于上海，1909年晚清郵傳部上海高等實業學堂（南洋公學）船政科開創了我國高等航海教育的先河。1912年成立吳淞商船學校，1933年更名為吳淞商船專科學校。1959年交通部在滬組建上海海運學院。2004年經教育部批準更名為上海海事大學。為更好地服務上海國際航運中心建設和國家航運事業發展，根據上海市高校布局結構調整規劃，2008年上海海事大學主體搬遷臨港新城。2009年學校舉行百年校慶系列活動。

        上海海事大學是一所以航運、物流、海洋為特色，具有工學、管理學、經濟學、法學、文學、理學和藝術學等學科門類的多科性大學。2008年，上海市人民政府與交通運輸部簽訂協議，共建上海海事大學。

        學校設有2個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程），2個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程），19個二級學科博士點，13個一級學科碩士學位授權點，59個二級學科碩士學位授權點，6個專業學位碩士授權點，46個本科專業，10個專科（高職）專業。擁有11個省部級重點研究基地。現有1個國家重點（培育）學科，5個國家級特色專業，1個上海市高峰學科，2個上海市高原學科，9個部市級重點學科，17個上海市本科教育高地。設有水上訓練中心，擁有萬噸級集裝箱教學實習船“育鋒”輪，4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。